土木工程专业考研时，选择数学一还是数学二主要取决于以下因素：
1. 专业要求：部分土木工程专业要求考生参加数学一考试，尤其是与力学、地质、岩土工程等相关专业。而数学二则更偏向于经济学、管理学等学科。
2. 课程内容：数学一涵盖的内容更为广泛，包括高等数学、线性代数、概率论与数理统计；数学二则更侧重于高等数学和线性代数。
3. 个人基础：考生应根据自己的数学基础来选择。如果数学基础较好，建议选择数学一；如果数学基础一般，选择数学二可能更为合适。
4. 考试难度：通常认为数学一比数学二难度更大，但具体还需根据个人情况而定。
综上所述，建议考生根据自身专业要求、课程内容、个人基础和考试难度等因素综合考虑，选择最适合自己的数学考试科目。
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